河西走廊地区A(b)值动态演化特征及在地震预测中的应用     

苏宏伟  肖淑娟 《地震地磁观测与研究》2011,32(4):12-15

采用A(b)值空间扫描方法对1980年以来河西走廊及其临近地区ML 2.3到ML 4.9地震资料进行了研究,统计分析了Ms 4.6以上地震前A(b)值异常情况,结果显示大多数Ms 4.6以上地震发生前的1-3年内,震中周围出现A(b)≥5.0的高值异常区域.R值检验结果为0.458.  相似文献   

细鳞斜颌鲴(Plagiognathops microlepis)三个群体线粒体Cyt b基因的遗传变异     

乔德亮  何晓梅  韦传宝  杨露  胡利  李思发 《湖泊科学》2011,23(5):813-820

应用线粒体Cyt b基因序列分析法,研究了细鳞斜颌鲴三个群体(粱子湖群体19尾、龙窝湖群体19尾、淮河群体18尾)的遗传变异关系.结果显示:细鳞斜颌鲴线粒体Cyt b基因大小为1149 bp.三个群体共测出10种单倍型,116个核苷酸变异位点,多态位点百分率为10.09％,碱基组成中A+T含量(57％左右)明显高于G+...  相似文献   

魁蚶(Scapharca broughtonii)半乳糖凝集素(SbGal)基因cDNA的克隆及表达分析   总被引：3，自引：2，他引：1  

郑利兵  吴彪  刘志鸿  周丽青  孙秀俊  田吉腾  杨爱国  郑言鑫 《海洋与湖沼》2015,46(5):1061-1070

半乳糖凝集素(Galectin)作为动物凝集素家族的一员,是一种重要的免疫因子,在脊椎动物和无脊椎动物中都参与了重要的免疫防御反应。为明确魁蚶(Scapharca broughtonii)半乳糖凝集素基因的结构特征、组织分布及其对病原菌刺激的免疫反应规律,本研究从构建的魁蚶转录组文库中筛选得到半乳糖凝集素基因部分序列,通过c DNA末端快速扩增(rapid amplication of c DNA ends,RACE)技术获得该基因c DNA全长序列(命名为Sb Gal)。序列和结构分析表明,该c DNA全长3120bp,编码554个氨基酸,是一个含有4个糖识别结构域(CRD)的且在双壳贝类中较为独特的半乳糖凝集素;预测蛋白的分子量(Mw)为63.3158 k Da,理论等电点(p I)为4.99。同源性及系统分析表明,Sb Gal基因与美洲牡蛎、合浦珠母贝、海湾扇贝galectin的同源性分别为70%、65%、46%,Sb Gal基因四个CRD彼此的相似性为36%—41%。实时荧光定量PCR(q RT-PCR)结果表明:Sb Gal m RNA在魁蚶血细胞、斧足、闭壳肌、外套膜、鳃和肝胰腺中均有表达,血细胞中的表达量最高,在肝胰腺中的表达量最低;注射鳗弧菌后,相对于对照组,Sb Gal基因在所检测的每个组织中m RNA水平上的表达量都显著上调(P0.01),而且表达量具有显著的时间依赖性和瞬时表达趋势,呈现先升高后降低的趋势。  相似文献   

性类固醇激素E₂、MT 对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)雌、雄生长差异的影响     

马细兰  张勇  陈勇智  周立斌 《海洋与湖沼》2015,46(6):1487-1493

性类固醇激素对动物生长有一定的影响, 但其对鱼类雌、雄生长差异的影响机理尚不清楚。 为进一步了解动物雌雄生长差异的内在原因, 本文通过在体注射和荧光定量PCR 方法, 比较了性类 固醇激素(E₂、MT)对尼罗罗非鱼雌鱼和雄鱼的生长及对垂体GH、肝脏GHR1、IGF-I mRNA 表达的 影响。结果表明: 性类固醇激素E₂ 和MT 对尼罗罗非鱼的生长及生长轴相关基因的表达均有显著的 影响, 并且这种影响存在明显的性别二态性。E₂ 明显促进雌鱼的生长但不显著影响雄鱼的生长, MT 显著促进雄鱼和雌鱼的生长; E₂ 可使雌鱼垂体GH 和肝脏GHR1 、IGF-I 的mRNA 水平显著升高 (P<0.05), 但降低雄鱼垂体GH和肝脏GHR1的mRNA表达; MT 显著提高雄鱼垂体GH和肝脏GHR1、 IGF-I mRNA 水平(P<0.05), 但降低雌鱼垂体GH 的mRNA 表达, 促进雌鱼肝脏GHR1 mRNA 的表达, 但对雄鱼肝脏GHR1 的促进作用明显大于雌鱼(P<0.05).上述结果表明, 性类固醇激素对不同性别尼 罗罗非鱼的生长及生长轴相关基因的mRNA 表达有不同的影响, 表现出明显的性别二态性, 提示不 同性别鱼体内性类固醇激素水平的不同可能是导致尼罗罗非鱼雌雄生长二态性的另一内在原因。  相似文献   

脊尾白虾蜕皮抑制激素基因全长cDNA的克隆及其对环境胁迫的响应     

张美  刘萍  李吉涛  李健 《海洋与湖沼》2015,46(4):764-775

为研究脊尾白虾蜕皮抑制激素基因(MIH)在环境适应中的作用,本文采用RACE技术从蜕皮间期脊尾白虾眼柄中克隆获得MIH-like基因全长c DNA序列,命名为Ec MIH。该基因全长1218bp,包括360bp的开放阅读框,420bp的5'端非编码区和394bp的3'端非编码区;开放阅读框编码120个氨基酸,包括41个氨基酸组成的信号肽和79个氨基酸组成的成熟肽,预测蛋白分子量为13.71k Da,理论等电点p I为8.02。同源性比较分析发现,脊尾白虾MIH-like基因与日本沼虾和罗氏沼虾同源性最高,分别为87%和86%。荧光定量PCR分析结果表明,脊尾白虾MIH-like基因在眼柄中的表达量最高,在卵巢中的表达量最少,而在肝脏、肌肉、鳃和血细胞中不表达。环境胁迫后该基因具有明显的时序性。p H6.5胁迫后24h和48h,眼柄和腹神经节中MIH-like基因的表达量较对照组均显著增加(P0.05);4mg/L氨氮浓度组胁迫后12h和24h,眼柄和腹神经节中MIH-like基因的表达量较对照组均显著增加(P0.05);盐度39胁迫后12h和24h,眼柄和腹神经节中MIH-like基因的表达量较对照组均显著增加(P0.05)。本研究结果表明脊尾白虾mih基因参与了环境胁迫后的机体应激反应。  相似文献   

High connectivity and directional gene flow in European Atlantic and Mediterranean populations of Ciona intestinalis sp. A          下载免费PDF全文

Ornella Affinito  Nikos Andreakis  Luigi Caputi  Rita Marino  Raimondo Pannone  Paolo Sordino  Gabriele Procaccini 《Marine Ecology》2015,36(4):1230-1243

Understanding the factors that cause population divergence has long been of interest to marine biologists in their attempts to interpret the effect of human‐mediated vectors. Broadcast‐spawning species with limited dispersal capability are excellent candidates to measure the present‐day patterns of genetic diversity. The tunicate Ciona intestinalis (Ascidiacea) is comprised of a complex of morphologically cryptic species that form vigorous aggregates in eutrophic habitats (harbors, gulfs and lagoons) where they can compete with the epibenthic community and cause biofouling problems. This study investigated biogeographic variability and migration patterns of C. intestinalis sp. A along Northeast Atlantic and Mediterranean coasts using microsatellite markers. Data presented here on 371 specimens collected from 17 populations reveal high genetic polymorphism, but with a deficit of heterozygote deficiency. Absence of evidence for isolation by distance suggests that the genetic patterns do not reflect the geographic distribution of sampled populations. Substantial gene flow and artificial potential for dispersal boost high levels of within‐population genetic variability and prevent genetic differentiation within and between seas. A predominant eastward migration pattern was revealed by the data set, with very limited opportunity for C. intestinalis sp. A to travel westward. This directional movement indicates that other properties (e.g. habitat quality, genetic traits, mating system, life cycle) may cause adaptive divergence at a large biogeographic scale.  相似文献   

Fine‐scale diet of the Australian sea lion (Neophoca cinerea) using DNA‐based analysis of faeces          下载免费PDF全文

Kristian J. Peters  Kathy Ophelkeller  Nathan J. Bott  Bruce E. Deagle  Simon N. Jarman  Simon D. Goldsworthy 《Marine Ecology》2015,36(3):347-367

We applied DNA‐based faecal analysis to determine the diet of female Australian sea lions (n = 12) from two breeding colonies in South Australia. DNA dietary components of fish and cephalopods were amplified using the polymerase chain reaction and mitochondrial DNA primers targeting the short (~100 base pair) section of the 16S gene region. Prey diversity was determined by sequencing ~50 amplicons generated from clone libraries developed for each individual. Faecal DNA was also combined and cloned from multiple individuals at each colony and fish diversity determined. Diets varied between individuals and sites. Overall, DNA analysis identified a broad diversity of prey comprising 23 fish and five cephalopod taxa, including many species not previously described as prey of the Australian sea lion. Labridae (wrasse), Monacanthidae (leatherjackets) and Mullidae (goat fish) were important fish prey taxa. Commonly identified cephalopods were Octopodidae (octopus), Loliginidae (calamary squid) and Sepiidae (cuttlefish). Comparisons of fish prey diversity determined by pooling faecal DNA from several samples provided a reasonable but incomplete resemblance (55–71%) to the total fish diversity identified across individual diets at each site. Interpretation of diet based on the recovery of prey hard‐parts identified one cephalopod beak (Octopus sp.) and one fish otolith (Parapriacanthus elongatus). The present study highlights the value of DNA‐based analyses and their capabilities to enhance information of trophic interactions.  相似文献   

伶鼬榧螺(Oliva mustelina)的分子鉴定及其形态变异     

李海涛  何薇  周鹏  陈凯彪  董燕红 《海洋学报》2015,37(4):117-123

根据榧螺螺旋部的差异可将其分为两种不同的形态类型,类型Ⅰ(MorphotypeⅠ)的个体螺旋部陷入体螺层中,其壳顶与前部数螺层愈合;类型Ⅱ(MorphotypeⅡ)的个体螺旋部高出壳顶,缝合线明显,此类型可明确鉴定为伶鼬榧螺(Oliva mustelina)。本研究通过线粒体COⅠ和16SrRNA基因序列的分析对两种形态类型的榧螺进行了分子鉴定。结果表明:两种形态类型的榧螺含有共享的单倍型;不同形态类型间的遗传距离和同一形态类型内的遗传距离重叠;两者的单系性在系统发育分析中没有得到显现,而是共同构成一个单系。因此,两种形态类型的个体均为伶鼬榧螺。类型Ⅰ可能是伶鼬榧螺中一种少见的有别于典型个体的形态变异类型。  相似文献   

松江鲈(Trachidermus fasciatus)泛素结合酶E2-D2基因的分子克隆及组织表达分析     

陈学昭  张雷  于珊珊  毕彩红  刘春影  祝茜 《海洋学报》2015,37(10):133-140

泛素结合酶(UbcE2)是蛋白泛素化过程中所必需的酶,在泛素转移和底物的特异性识别方面发挥着重要的作用。本实验利用RACE技术克隆获得了全长为993bp的松江鲈泛素结合酶E2-D2基因cDNA序列(命名为TfUbcE2-D2),其开放阅读框为444bp,编码147个氨基酸。通过SMART预测得知,TfUbcE2-D2含有一个UBCc结构域。同源比对结果表明该基因与其他物种的同源性为92.31%。实时荧光定量PCR显示,TfUbcE2-D2广泛表达于松江鲈各组织,在肾脏中的相对表达量最高,其次为鳃。鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激后,TfUbcE2-D2在血液、脾脏、肝脏和鳃中表达均上调,其中,脾脏和鳃中的表达量上调约40倍。由以上实验结果推测,TfUbcE2-D2可能参与松江鲈的先天免疫防御。  相似文献   

中国南海一株固氮类芽孢杆菌的筛选和分离鉴定   总被引：1，自引：0，他引：1  

张丽红  刘艳芳  胡青平 《海洋科学》2015,39(3):100-105

为了解中国南海海洋自生固氮菌的种类,作者对采集的南海海底淤泥样品进行了固氮微生物的分离、筛选及鉴定。经过土样沸水加热处理,无氮培养基平板初筛后,对分离获得的细菌固氮酶结构基因nif H进行扩增,并对其固氮酶活性进行检测,最终获得一株能够产芽孢的固氮细菌。对该菌株进行生理生化性状测定、16S r DNA序列分析(Gen Bank登录号KJ627376),并基于nif H、16S r DNA系统进化树分析,确定该菌为一株固氮类芽孢菌(Paenibacillus sp.)NH-1。本研究表明固氮类芽孢杆菌在海洋中确有分布,海洋自生固氮菌的多样性远远超出人们之前的认识。  相似文献